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一种基于混合线性模型的种子数量性状位点定位方法  
 【申请号】  CN201310549029.0  【申请日】  2013-11-07
 【公开号】  CN103632067A  【公开日】  2014-03-12
 【申请人】  浙江大学  【地址】  310027 浙江省杭州市西湖区浙大路38号
 【共同申请人】  
 【发明人】  徐海明;祁婷;曹玉杰;祝水金;楼向阳
 【国际申请】    【国际公布】  
 【进入国家日期】  
 【专利代理机构】  杭州天勤知识产权代理有限公司 33224  【代理人】  胡红娟
 【分案原申请号】  
 【国省代码】  33
 【摘要】  本发明公开了一种基于混合线性模型的种子数量性状位点定位方法,包括:建立统计遗传模型;在全基因组范围内搜索所有可能存在QTL的候选标记区间:将所述的候选标记区间作为协变量,在全基因组范围内搜索显著的QTL位点和二互作标记区间;以所述的QTL位点和二互作标记区间作为协变量,在显著的互作标记区间内搜索显著的二互作上位性的位点;通过所述QTL位点和二互作上位性的位点,获得统计遗传模型中各种效应的系数,然后通过统计遗传模型,计算这些位点的效应以及估算每个位点的遗传率。本发明将种子性状分成二倍体种子和三倍体种子,考虑了上位性效应及基因与环境互作的效应,可快速无偏的估计种子数量性状位点的位置及各种效应。
 【主权项】  一种基于混合线性模型的三倍体种子数量性状位点定位方法,其特征在于,包括:(1)统计遗传模型的建立:对一衍生于两个纯合亲本(P1,P2)的交配作图群体,假设在t个不同的环境下进行遗传实验,每个环境设置b个区组,某一种子数量性状的变异受s个QTL(Q1,Q2,……,Qs)和t个上位性的调控,则环境h中第j个区组内第i个株系后代种子性状表型观测值(yhij)可用下面的混合线性模型(1)表示: y hij
 【页数】  22
 【主分类号】  G06F19/12
 【专利分类号】  G06F19/12
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